Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPMQ9NSP4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPMQ9NSP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms