Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WDR55Q9H6Y2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WDR55Q9H6Y2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR55Q9H6Y2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms