Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E3

SAP130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP130Q9H0E3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SAP130Q9H0E3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SAP130Q9H0E3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAP130Q9H0E3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAP130Q9H0E3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms