Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM117Q9H0C3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM117Q9H0C3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM117Q9H0C3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM117Q9H0C3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms