Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FOXP3Q9BZS1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXP3Q9BZS1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FOXP3Q9BZS1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXP3Q9BZS1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms