Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RSPO3Q9BXY4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RSPO3Q9BXY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RSPO3Q9BXY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RSPO3Q9BXY4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms