Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM43Q9BTV4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM43Q9BTV4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms