Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPP1R9BQ96SB3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP1R9BQ96SB3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP1R9BQ96SB3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP1R9BQ96SB3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms