Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NODALQ96S42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NODALQ96S42 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NODALQ96S42 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NODALQ96S42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms