Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PANX1Q96RD7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PANX1Q96RD7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PANX1Q96RD7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms