Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP4Q96PP9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP4Q96PP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP4Q96PP9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GBP4Q96PP9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms