Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf85Q96MD7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf85Q96MD7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1177.3 ms