Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP36Q96G28 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP36Q96G28 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP36Q96G28 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP36Q96G28 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms