Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC4Q96FT7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC4Q96FT7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC4Q96FT7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC4Q96FT7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms