Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERCC4Q92889 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERCC4Q92889 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERCC4Q92889 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms