Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKL2Q92772 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKL2Q92772 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKL2Q92772 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms