Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGCDQ92629 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SGCDQ92629 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGCDQ92629 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms