Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LPGAT1Q92604 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LPGAT1Q92604 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LPGAT1Q92604 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LPGAT1Q92604 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms