Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG3Q8WXD2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCG3Q8WXD2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCG3Q8WXD2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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