Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHTF18Q8WVB6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHTF18Q8WVB6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms