Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NSMCE1Q8WV22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSMCE1Q8WV22 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NSMCE1Q8WV22 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms