Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAF3IP1Q8TDR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAF3IP1Q8TDR0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms