Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL2Q8NHH9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATL2Q8NHH9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATL2Q8NHH9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms