Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM229BQ8NBD8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM229BQ8NBD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM229BQ8NBD8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms