Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP38Q8NB14 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP38Q8NB14 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP38Q8NB14 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP38Q8NB14 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms