Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVOPQ8N4V2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVOPQ8N4V2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SVOPQ8N4V2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms