Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDCL2Q8N4E4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDCL2Q8N4E4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDCL2Q8N4E4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms