Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 CPT1A-209ENST00000569129 499 ntTSL 49.72□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 43
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AGGF1Q8N302 UQCRB-207ENST00000521036 982 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-12■■■■■ 42.9
AGGF1Q8N302 UQCRB-203ENST00000517603 1041 ntTSL 1 (best)8.24□□□□□ -1.091e-12■■■■■ 42.9
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AGGF1Q8N302 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 314.55□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 42.9
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AGGF1Q8N302 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.489e-8■■■■■ 42.7
AGGF1Q8N302 CREBBP-218ENST00000636895 100 ntTSL 53.88□□□□□ -1.799e-8■■■■■ 42.7
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AGGF1Q8N302 GRID1-201ENST00000327946 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 42.5
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AGGF1Q8N302 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 42.4
AGGF1Q8N302 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-7■■■■■ 42.4
AGGF1Q8N302 SH3TC1-210ENST00000506360 5829 ntTSL 216.89■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 42.2
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AGGF1Q8N302 SH3TC1-204ENST00000502350 2258 ntTSL 214.59□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 42.2
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AGGF1Q8N302 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 42.2
AGGF1Q8N302 SH3TC1-205ENST00000502559 3798 ntTSL 214.05□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 42.2
AGGF1Q8N302 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 42.2
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AGGF1Q8N302 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 42.2
AGGF1Q8N302 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 42.2
AGGF1Q8N302 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.267e-7■■■■■ 42.2
AGGF1Q8N302 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.187e-7■■■■■ 42.2
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AGGF1Q8N302 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 42
AGGF1Q8N302 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 220.37■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 42
AGGF1Q8N302 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 42
AGGF1Q8N302 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 42
AGGF1Q8N302 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 28.01□□□□□ -1.134e-7■■■■■ 42
AGGF1Q8N302 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.954e-7■■■■■ 42
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AGGF1Q8N302 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.372e-9■■■■■ 42
AGGF1Q8N302 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 42
AGGF1Q8N302 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 41.9
AGGF1Q8N302 SIPA1L3-203ENST00000594553 374 ntTSL 34.35□□□□□ -1.715e-7■■■■■ 41.9
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AGGF1Q8N302 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 36.68□□□□□ -1.341e-11■■■■■ 41.5
AGGF1Q8N302 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 41.5
AGGF1Q8N302 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-11■■■■■ 41.5
AGGF1Q8N302 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 41.4
AGGF1Q8N302 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 41.4
AGGF1Q8N302 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 41.4
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AGGF1Q8N302 SLC12A6-210ENST00000559236 576 ntTSL 422.85■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 41.3
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AGGF1Q8N302 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 SLC12A6-214ENST00000559664 5111 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 41.3
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AGGF1Q8N302 SLC12A6-202ENST00000354181 4568 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 SLC12A6-203ENST00000397702 4096 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.143e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC12.56□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-203ENST00000398763 1224 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 MICU1-206ENST00000489666 579 ntTSL 48.04□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 41.3
AGGF1Q8N302 HERC2P3-205ENST00000428453 4383 ntTSL 210.59□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 41.2
AGGF1Q8N302 HERC2P3-209ENST00000437318 4161 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 41.2
AGGF1Q8N302 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 41.2
AGGF1Q8N302 ANGPT1-207ENST00000521950 1177 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 41.1
AGGF1Q8N302 ANGPT1-203ENST00000518386 813 ntTSL 36.29□□□□□ -1.42e-10■■■■■ 41.1
AGGF1Q8N302 ARHGEF1-218ENST00000599589 2636 ntTSL 1 (best)20.64■□□□□ 0.96e-7■■■■■ 40.9
AGGF1Q8N302 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC12.8□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 40.9
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