Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VSIG1Q86XK7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VSIG1Q86XK7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VSIG1Q86XK7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSIG1Q86XK7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms