Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW1

SLC22A16, Solute carrier family 22 member 16, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A16Q86VW1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC22A16Q86VW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC22A16Q86VW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A16Q86VW1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A16Q86VW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A16Q86VW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms