Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG4DQ86TL0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATG4DQ86TL0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms