Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C16orf62Q7Z3J2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C16orf62Q7Z3J2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C16orf62Q7Z3J2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms