Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 SAP18-204ENST00000471009 670 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-12■■■■■ 30.6
LARP4Q71RC2 SAP18-206ENST00000492245 405 ntTSL 45.71□□□□□ -1.52e-12■■■■■ 30.6
LARP4Q71RC2 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-12■■■■■ 30.6
LARP4Q71RC2 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 30.6
LARP4Q71RC2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.584e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 224.43■■□□□ 1.54e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.454e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 222.24■■□□□ 1.154e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)21.43■■□□□ 1.024e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-207ENST00000454179 781 ntTSL 217.23■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-210ENST00000537558 861 ntTSL 416.93■□□□□ 0.34e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 216.51■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 PSMA5-203ENST00000484563 1503 ntTSL 215.03■□□□□ -04e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-212ENST00000539351 564 ntTSL 414.86□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 RBP1-202ENST00000474490 462 ntTSL 210.47□□□□□ -0.734e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.064e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 PSMA5-205ENST00000491287 225 ntTSL 37.06□□□□□ -1.284e-8■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 SCLT1-202ENST00000439369 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.489e-7■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 SCLT1-201ENST00000281142 3055 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 30.5
LARP4Q71RC2 MBOAT2-207ENST00000477073 754 ntTSL 320.2■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 30.4
LARP4Q71RC2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 30.4
LARP4Q71RC2 MBOAT2-203ENST00000462696 580 ntTSL 413.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 30.4
LARP4Q71RC2 MBOAT2-206ENST00000474341 713 ntTSL 55□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 30.4
LARP4Q71RC2 MBOAT2-209ENST00000486484 1351 ntTSL 24.67□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 30.4
LARP4Q71RC2 MBOAT2-202ENST00000460786 550 ntTSL 33.02□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 30.4
LARP4Q71RC2 MZT2A-205ENST00000488586 234 ntTSL 513.42□□□□□ -0.267e-10■■■■■ 30.4
LARP4Q71RC2 EHBP1-213ENST00000462441 332 ntTSL 35.11□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 30.3
LARP4Q71RC2 CCDC57-207ENST00000419322 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.09■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 30.3
LARP4Q71RC2 CCDC57-214ENST00000582040 330 ntTSL 313.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 30.3
LARP4Q71RC2 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 30.3
LARP4Q71RC2 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 30.2
LARP4Q71RC2 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 30.2
LARP4Q71RC2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 CPQ-202ENST00000517742 660 ntTSL 56.73□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 CPQ-204ENST00000519900 566 ntTSL 46.49□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 412.15□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 HBA2-203ENST00000482565 640 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.179e-77■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.139e-77■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.749e-77■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.727e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.047e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 SWI5-202ENST00000372898 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.78□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.285e-8■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 ID3-202ENST00000463312 623 ntTSL 210.76□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 SWI5-203ENST00000418976 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 VAMP8-201ENST00000263864 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.95e-8■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 VAMP8-202ENST00000409760 805 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.015e-8■■■■■ 30.1
LARP4Q71RC2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 ATG10-204ENST00000504770 813 ntTSL 37.07□□□□□ -1.284e-6■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.554e-6■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.372e-12■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 TOMM7-206ENST00000496129 520 ntTSL 1 (best)5.7□□□□□ -1.52e-12■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 SLC4A2-208ENST00000469467 442 ntTSL 28.97□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 30
LARP4Q71RC2 AC002480.1-201ENST00000442252 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.099e-7■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 S100A6-204ENST00000462951 311 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 MAD1L1-212ENST00000450235 850 ntTSL 315.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 PKIB-212ENST00000618977 464 ntTSL 38.46□□□□□ -1.066e-6■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 PKIB-210ENST00000608895 595 ntTSL 37.76□□□□□ -1.176e-6■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.336e-6■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 PKIB-208ENST00000583007 394 ntTSL 56.57□□□□□ -1.366e-6■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.446e-6■■■■■ 29.9
LARP4Q71RC2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 29.8
LARP4Q71RC2 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 510.77□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 29.8
LARP4Q71RC2 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.499e-7■■■■■ 29.8
LARP4Q71RC2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 29.8
LARP4Q71RC2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 29.8
LARP4Q71RC2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 29.8
LARP4Q71RC2 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 29.8
LARP4Q71RC2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.485e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NDUFA11-204ENST00000591341 403 ntTSL 214.77□□□□□ -0.053e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.319e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.279e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.959e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.899e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 325.01■■□□□ 1.599e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-211ENST00000478582 937 ntTSL 324.96■■□□□ 1.599e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.519e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.499e-6■■■■■ 29.6
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 277 ms