Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYS1Q717R9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CYS1Q717R9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYS1Q717R9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYS1Q717R9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYS1Q717R9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYS1Q717R9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYS1Q717R9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms