Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHSY3Q70JA7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHSY3Q70JA7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHSY3Q70JA7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms