Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF549Q6P9A3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF549Q6P9A3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF549Q6P9A3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms