Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TAF3Q5VWG9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF3Q5VWG9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms