Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL5A1-AS1Q5SY13 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COL5A1-AS1Q5SY13 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms