Protein–RNA interactions for Protein: Q5RI15

COX20, Cytochrome c oxidase protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX20Q5RI15 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX20Q5RI15 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX20Q5RI15 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX20Q5RI15 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX20Q5RI15 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms