Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HABP4Q5JVS0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HABP4Q5JVS0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HABP4Q5JVS0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HABP4Q5JVS0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms