Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VWA3BQ502W6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VWA3BQ502W6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VWA3BQ502W6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms