Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTDC1Q4AE62 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTDC1Q4AE62 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTDC1Q4AE62 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GTDC1Q4AE62 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTDC1Q4AE62 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTDC1Q4AE62 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTDC1Q4AE62 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms