Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMN1Q16637 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMN1Q16637 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMN1Q16637 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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