Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6AP1Q15904 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6AP1Q15904 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
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