Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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