Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAM2Q15035 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAM2Q15035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAM2Q15035 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM2Q15035 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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