Protein–RNA interactions for Protein: Q15005

SPCS2, Signal peptidase complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS2Q15005 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPCS2Q15005 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPCS2Q15005 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPCS2Q15005 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPCS2Q15005 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPCS2Q15005 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPCS2Q15005 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPCS2Q15005 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPCS2Q15005 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPCS2Q15005 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms