Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NR1I3Q14994 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1I3Q14994 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR1I3Q14994 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1I3Q14994 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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