Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 MRPS18YNL306W 654 nt5.66□□□□□ -1.5
USB1Q12208 LDB19YOR322C 2457 nt5.66□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YLL066CYLL066C 3618 nt5.66□□□□□ -1.5
USB1Q12208 EMW1YNL313C 2715 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 SHO1YER118C 1104 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 LCL3YGL085W 825 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YJR146WYJR146W 354 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YKL077WYKL077W 1179 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 YKL102CYKL102C 306 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 SUR7YML052W 909 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 DFR1YOR236W 636 nt5.65□□□□□ -1.5
USB1Q12208 CYC8YBR112C 2901 nt5.65□□□□□ -1.51
USB1Q12208 ARP3YJR065C 1350 nt5.65□□□□□ -1.51
USB1Q12208 HIS7YBR248C 1659 nt5.64□□□□□ -1.51
USB1Q12208 FAL1YDR021W 1200 nt5.64□□□□□ -1.51
USB1Q12208 DYS1YHR068W 1164 nt5.64□□□□□ -1.51
USB1Q12208 MRPL23YOR150W 492 nt5.64□□□□□ -1.51
USB1Q12208 YPL257WYPL257W 582 nt5.64□□□□□ -1.51
USB1Q12208 PEX3YDR329C 1326 nt5.64□□□□□ -1.51
USB1Q12208 HXK2YGL253W 1461 nt5.64□□□□□ -1.51
USB1Q12208 HEM1YDR232W 1647 nt5.63□□□□□ -1.51
USB1Q12208 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.63□□□□□ -1.51
USB1Q12208 LYS1YIR034C 1122 nt5.63□□□□□ -1.51
USB1Q12208 LSC1YOR142W 990 nt5.63□□□□□ -1.51
USB1Q12208 SMK1YPR054W 1167 nt5.63□□□□□ -1.51
USB1Q12208 HXT2YMR011W 1626 nt5.63□□□□□ -1.51
USB1Q12208 TKL2YBR117C 2046 nt5.62□□□□□ -1.51
USB1Q12208 GCG1YER163C 699 nt5.62□□□□□ -1.51
USB1Q12208 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.62□□□□□ -1.51
USB1Q12208 SRY1YKL218C 981 nt5.62□□□□□ -1.51
USB1Q12208 SAL1YNL083W 1485 nt5.62□□□□□ -1.51
USB1Q12208 CIT3YPR001W 1461 nt5.62□□□□□ -1.51
USB1Q12208 OM45YIL136W 1182 nt5.61□□□□□ -1.51
USB1Q12208 OGG1YML060W 1131 nt5.61□□□□□ -1.51
USB1Q12208 YBR226CYBR226C 411 nt5.61□□□□□ -1.51
USB1Q12208 MIP1YOR330C 3765 nt5.6□□□□□ -1.51
USB1Q12208 PMP3YDR276C 168 nt5.6□□□□□ -1.51
USB1Q12208 VMA3YEL027W 483 nt5.6□□□□□ -1.51
USB1Q12208 AIM20YIL158W 615 nt5.6□□□□□ -1.51
USB1Q12208 FBA1YKL060C 1080 nt5.6□□□□□ -1.51
USB1Q12208 YNL120CYNL120C 486 nt5.6□□□□□ -1.51
USB1Q12208 PMT3YOR321W 2262 nt5.59□□□□□ -1.51
USB1Q12208 HSP12YFL014W 330 nt5.59□□□□□ -1.51
USB1Q12208 CTF19YPL018W 1110 nt5.59□□□□□ -1.51
USB1Q12208 POP1YNL221C 2628 nt5.59□□□□□ -1.52
USB1Q12208 THI2YBR240C 1353 nt5.58□□□□□ -1.52
USB1Q12208 POX1YGL205W 2247 nt5.58□□□□□ -1.52
USB1Q12208 IMG1YCR046C 510 nt5.58□□□□□ -1.52
USB1Q12208 RPP1YHR062C 882 nt5.58□□□□□ -1.52
USB1Q12208 RSP5YER125W 2430 nt5.58□□□□□ -1.52
USB1Q12208 BDF2YDL070W 1917 nt5.58□□□□□ -1.52
USB1Q12208 NOG2YNR053C 1461 nt5.58□□□□□ -1.52
USB1Q12208 CTF8YHR191C 402 nt5.57□□□□□ -1.52
USB1Q12208 SQT1YIR012W 1296 nt5.57□□□□□ -1.52
USB1Q12208 LDB16YCL005W 771 nt5.57□□□□□ -1.52
USB1Q12208 CCT8YJL008C 1707 nt5.57□□□□□ -1.52
USB1Q12208 SES1YDR023W 1389 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 ERG8YMR220W 1356 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 TRP5YGL026C 2124 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 MDE1YJR024C 735 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 AIM24YJR080C 1185 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 MHT1YLL062C 975 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 MSY1YPL097W 1479 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 CLN1YMR199W 1641 nt5.56□□□□□ -1.52
USB1Q12208 CDC16YKL022C 2523 nt5.55□□□□□ -1.52
USB1Q12208 MSS1YMR023C 1581 nt5.55□□□□□ -1.52
USB1Q12208 OPI7YDR360W 435 nt5.55□□□□□ -1.52
USB1Q12208 ILV6YCL009C 930 nt5.55□□□□□ -1.52
USB1Q12208 IRS4YKR019C 1848 nt5.55□□□□□ -1.52
USB1Q12208 PXL1YKR090W 2121 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 ALT2YDR111C 1524 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 YGR127WYGR127W 939 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 THI4YGR144W 981 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 YKL153WYKL153W 510 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 COX5AYNL052W 462 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 SCS22YBL091C-A 528 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 ECM38YLR299W 1983 nt5.54□□□□□ -1.52
USB1Q12208 POR2YIL114C 846 nt5.53□□□□□ -1.52
USB1Q12208 DID2YKR035W-A 615 nt5.53□□□□□ -1.52
USB1Q12208 RKI1YOR095C 777 nt5.53□□□□□ -1.52
USB1Q12208 ECM31YBR176W 939 nt5.53□□□□□ -1.52
USB1Q12208 CCC2YDR270W 3015 nt5.53□□□□□ -1.52
USB1Q12208 ARE2YNR019W 1929 nt5.52□□□□□ -1.53
USB1Q12208 UIP5YKR044W 1332 nt5.52□□□□□ -1.53
USB1Q12208 UTR2YEL040W 1404 nt5.52□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YPL136WYPL136W 369 nt5.52□□□□□ -1.53
USB1Q12208 GAA1YLR088W 1845 nt5.52□□□□□ -1.53
USB1Q12208 EFT2YDR385W 2529 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 EFT1YOR133W 2529 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 MEH1YKR007W 555 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YLR123CYLR123C 330 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 AIM33YML087C 939 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 SCS7YMR272C 1155 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 MSO1YNR049C 633 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 COQ3YOL096C 939 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 ZWF1YNL241C 1518 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YML133CYML133C 4125 nt5.51□□□□□ -1.53
USB1Q12208 YGR054WYGR054W 1929 nt5.5□□□□□ -1.53
USB1Q12208 PCS60YBR222C 1632 nt5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.8 ms