Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 SAL1YNL083W 1485 nt8.7□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 MEK1YOR351C 1494 nt8.7□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 GLE1YDL207W 1617 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 ACO2YJL200C 2370 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YDR401WYDR401W 564 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YIL168WYIL168W 384 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YLR194CYLR194C 765 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 ESBP6YNL125C 2022 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 NPP1YCR026C 2229 nt8.69□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 ECM8YBR076W 1065 nt8.68□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 HSE1YHL002W 1359 nt8.68□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 PPT1YGR123C 1542 nt8.68□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt8.67□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 SFP1YLR403W 2052 nt8.67□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 DOM34YNL001W 1161 nt8.67□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 NFI1YOR156C 2181 nt8.67□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 SMA1YPL027W 738 nt8.67□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 MMR1YLR190W 1476 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 OCH1YGL038C 1443 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 IMG2YCR071C 441 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YDL016CYDL016C 303 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YLF2YHL014C 1218 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 SFT2YBL102W 648 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 SMK1YPR054W 1167 nt8.66□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YHR177WYHR177W 1362 nt8.65□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 SRG1SRG1 551 nt8.65□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YGL177WYGL177W 348 nt8.65□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 SBP1YHL034C 885 nt8.65□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 IPP1YBR011C 864 nt8.65□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YPR147CYPR147C 915 nt8.65□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YSA1YBR111C 696 nt8.65□□□□□ -1.02
YRR1Q12172 YRF1-2YER190W 5046 nt8.65□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YHR131CYHR131C 2553 nt8.65□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 ARH1YDR376W 1482 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YHR218WYHR218W 1812 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 PET18YCR020C 648 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 NHP10YDL002C 612 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 IST3YIR005W 447 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 AIM22YJL046W 1230 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YMR178WYMR178W 825 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YMR245WYMR245W 621 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 BSC4YNL269W 396 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YPT11YNL304W 1254 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 CNS1YBR155W 1158 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 LEU4YNL104C 1860 nt8.64□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 ENO1YGR254W 1314 nt8.63□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 HOG1YLR113W 1308 nt8.63□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 CYC3YAL039C 810 nt8.63□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 REH1YLR387C 1299 nt8.63□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 USV1YPL230W 1176 nt8.63□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 TED1YIL039W 1422 nt8.63□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 GAS1YMR307W 1680 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 HXT10YFL011W 1641 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 DCV1YFR012W 609 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 SCL1YGL011C 759 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 HAM1YJR069C 594 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 IME1YJR094C 1083 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 MRPL13YKR006C 795 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YLL017WYLL017W 312 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 INP1YMR204C 1263 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 TRM10YOL093W 882 nt8.62□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 KTR4YBR199W 1395 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 KAR5YMR065W 1515 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 RTT103YDR289C 1230 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 GIC2YDR309C 1152 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 MRPL25YGR076C 474 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YOR364WYOR364W 369 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YEF1YEL041W 1488 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 THI3YDL080C 1830 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 PRP46YPL151C 1356 nt8.61□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 PTC6YCR079W 1329 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YDR132CYDR132C 1488 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YFR020WYFR020W 699 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 ELF1YKL160W 438 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 USB1YLR132C 873 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YLR456WYLR456W 615 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 CUP9YPL177C 921 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 HAL1YPR005C 885 nt8.6□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 GGA2YHR108W 1758 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YDL027CYDL027C 1263 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 LYS20YDL182W 1287 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 SER2YGR208W 930 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 RSM26YJR101W 801 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 GPM1YKL152C 744 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 SRP102YKL154W 735 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YMR007WYMR007W 381 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 SPO20YMR017W 1194 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 REX4YOL080C 870 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 SCD6YPR129W 1050 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YKR023WYKR023W 1593 nt8.59□□□□□ -1.03
YRR1Q12172 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt8.58□□□□□ -1.04
YRR1Q12172 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt8.58□□□□□ -1.04
YRR1Q12172 TFC7YOR110W 1308 nt8.58□□□□□ -1.04
YRR1Q12172 ATG32YIL146C 1590 nt8.58□□□□□ -1.04
YRR1Q12172 NSE3YDR288W 912 nt8.58□□□□□ -1.04
YRR1Q12172 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.58□□□□□ -1.04
YRR1Q12172 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28 ms