Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTK2Q05397 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTK2Q05397 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTK2Q05397 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTK2Q05397 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms